Seq-SHM临床意义

Seq-SHM®

Seq-SHM检测通过二代基因测序为慢淋白血病和淋巴瘤患者提供预后信息和指导用药​

临床信息

在早期B细胞发育过程中,IGH基因是由多个多态性基因片段组装而成的,这些片段经历了重排和选择,产生了可变多样性连接(VDJ)组合,这种组合在每个B细胞的长度和序列上都是独特的。另外,在淋巴结的生发中心反应过程中,新获得的(体细胞)点突变被引入成熟B细胞的可变(V)区域,该过程称为体细胞超突变(Somatic Hypermutation, SHM)。由于B慢性淋巴细胞性白血病(B-CLL)和B系淋巴瘤源自单个B淋巴样细胞的恶性转化,因此每个子细胞共享1个或(多个)独特的“克隆”抗原受体基因重排,因此这是肿瘤特异性的(即肿瘤)的“指纹”。

本检测将报告免疫球蛋白重链基因(IGH)可变(V)区DNA中是否存在体细胞超突变。 大于2%的突变频率将被报告为已突变。 重排中确定的突变百分比和V区等位基因都将包括在报告中。缺乏IGHV区域体细胞高突变(未突变)的B细胞慢性淋巴细胞性白血病(B-CLL)与比IGHV区域体细胞高突变(突变)的B-CLL的预后差得多。同时,本检测也将报告TP53基因的突变信息,通常携带TP53突变的患者预后比为携带此基因突变的患者预后差的多。

Quantifying evolutionary constraints on B cell affinity maturation McCoy CO, Bedford T, Minin VN, Bradley P, Robins H, Matsen FA. 2015. Phil Trans R Soc B: 370: 20140244.

检测解读

此检测对患有血液,骨髓或组织癌变的慢性淋巴细胞性白血病或B淋巴瘤的患者有用。体细胞IGHV突变状态的预后价值目前仅适用于这种B细胞恶性肿瘤亚型,该测试不适用于其他T细胞肿瘤或急性B细胞白血病。

克隆IGHV基因高突变状态为CLL和B淋巴瘤患者提供重要的预后信息。 IGH SHM的存在被定义为与种系VH基因序列同一性差异大于2%(突变),而小于或等于2%的差异被视为无SHM(未突变)。 SHM的状态对患者的中位生存期有明显影响。 IGH可变区的超变强烈预示了良好的预后,而缺乏突变则预示了较差的预后。

慢性淋巴细胞白血病/小淋巴细胞淋巴瘤的NCCN诊断与治疗指南
参考文献:

1. Hamblin TJ, Davis Z, Gardiner A, et al: Unmutated Ig V(H) genes are associated with a more aggressive form of chronic lymphocytic leukemia. Blood 1999 September 15;94(6):1848-1854

2. Damle RN, Wasil T, Fais F, et al: Ig V gene mutation status and CD38 expression as novel prognostic indicators in chronic lymphocytic leukemia. Blood 1999 September 15;94(6):1840-1847

3. Langerak AW, Davi F, Ghia P, et al: Immunoglobulin sequence analysis and prognostication in CLL: guidelines from the ERIC review board for reliable interpretation of problematic cases. Leukemia 2011;25:979-984