艾沐蒽新抗原疫苗肽预测:个性化疫苗唤醒免疫系统,精准狙击肿瘤!

在肿瘤治疗领域,如何精准激活人体免疫系统以特异性攻击肿瘤细胞一直是研究的核心方向。而个性化新抗原疫苗的出现,为这一难题提供了全新的解决方案 —— 它以肿瘤细胞特有的突变抗原为靶点,通过定制化的设计和多佐剂协同作用,能够有效唤醒机体的免疫应答,诱导出针对肿瘤的特异性 T 细胞反应,为肿瘤患者带来了精准治疗的新希望。


近日发表于Cell的一篇研究聚焦于一种多佐剂个性化新抗原疫苗(NeoVaxMI)在黑色素瘤中的应用,这款疫苗通过精准靶向肿瘤特有的 “坏分子”(新抗原),成功唤醒人体免疫系统,为黑色素瘤的个性化治疗开辟了新道路。


研究方法

1、疫苗优化策略

先前研究中的新抗原疫苗虽然能诱导免疫反应,但CD8+ T 细胞应答不足。本研究旨在通过优化疫苗配方增强免疫原性,具体策略包括:

  • 加入矿物油佐剂 Montanide 以延长抗原暴露;

  • 局部联用 CTLA-4 抑制剂 ipilimumab 增强 T 细胞激活;

  • 系统联用 PD-1 抑制剂 nivolumab 减少免疫抑制。

2、研究设计

纳入 11 例黑色素瘤患者,其中 9 例完成 4 次完整接种疫苗。患者先接受nivolumab治疗,再接受NeoVaxMI疫苗,同时局部注射 ipilimumab,并持续 nivolumab 治疗。

3、疫苗制备

通过全外显子测序(WES)和RNA测序筛选肿瘤突变,利用 NetMHCpan 和 HLAthena 预测高免疫原性新表位。合成含新表位的长肽(16-26 氨基酸),分为 2 个肽库,与佐剂混合后接种。

4、免疫评估

通过 IFN-γ ELISpot 检测 T 细胞对疫苗肽的反应。对注射部位的肿瘤组织进行单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)和 TCR 测序(scTCR-seq)分析肿瘤内免疫细胞。并通过流式评估 T 细胞功能和表型。



主要研究结果



01

疫苗诱导了强效且持久的T细胞反应

所有完成接种的患者(9/9)均检测到针对疫苗肽库的 IFN-γ 反应,62.9%的疫苗肽可诱导 T 细胞应答,且持续至末次接种后 71 周。6/9 患者检测到 CD8+ T 细胞反应,表达 CD107a/b(提示细胞毒性),且 CD4+ 和 CD8+ T 细胞均具有多功能性。

02

注射部位免疫细胞动态变化

通过scRNAseq发现,疫苗注射后,注射部位多种髓系细胞和NK细胞、CD8+记忆T细胞显著增加,这些细胞的促炎基因和细胞毒性基因表达上调,提示局部炎症和免疫激活。

03

T细胞克隆型分析

循环T细胞克隆:在疫苗接种前后多个时间点采集外周血进行了bulkTCR测序。与nivolumab治疗相比,疫苗接种后TCRβ克隆型显著增加。疫苗接种后出现的克隆型中,高达31.3%显著扩增。体外实验显示,92.9% 的疫苗肽扩增 TCR 克隆来自疫苗后新出现的克隆,证实其疫苗特异性。(图1)

图1

肿瘤内T细胞克隆:在4例患者的肿瘤样本中检测到疫苗诱导的TCR克隆型(占肿瘤TCR的0.4%-2.7%),且这些克隆先在血液中出现,提示T细胞向肿瘤迁移。在完全缓解的患者(P103)的肿瘤中,CD8+ T 细胞比例升高,CD8/CD4 Treg 比值增加,且 T 细胞表达效应分子(如 NKG7、GZMK)和免疫检查点分子(如 PDCD1),提示功能活性。(图2)

图2

在P103患者中,疫苗特异性CD8+ T细胞主要表现为前体耗竭型,表达多种细胞毒性标志物。而在其他患者中肿瘤内T细胞主要为CD4+ T细胞,可能为“旁观者”反应。


研究结论

本研究通过多佐剂协同策略,成功将个性化新抗原疫苗的免疫原性提升至新高度,为黑色素瘤及其他癌种的免疫治疗提供了重要范式。尽管样本有限,但转化潜力显著,标志着个性化癌症疫苗从“可行”迈向“强效”的关键一步。

参考文献

Blass E, Keskin DB, Tu CR, et al. A multi-adjuvant personal neoantigen vaccine generates potent immunity in melanoma. Cell. Published online July 9, 2025. doi:10.1016/j.cell.2025.06.019

艾沐蒽科研服务
新抗原预测和疫苗肽设计

在免疫治疗蓬勃发展的当下,精准靶向肿瘤的个性化疗法成为研究焦点。艾沐蒽科研服务聚焦个性化免疫治疗,提供从新抗原到疫苗的全链条支持。基于 TCR 精准预测肿瘤专属新抗原,通过专业技术验证其免疫原性,再量身设计高效疫苗肽序列,助力加速个性化新抗原疫苗研发,为科研突破注入核心动力!

01
什么是新癌抗原?

新癌抗原(Neo-antigen),就是特属个体肿瘤的基因翻译蛋白以抗原形式呈递在癌细胞或抗原呈递细胞表面,能被免疫系统识别,从而精准区分正常组织与癌组织


通过肿瘤细胞基因测序,找到患者特有的癌携基因,结合HLA分型进行免疫呈递亲和力预测,筛选出由癌携基因编码的癌抗原,即新癌抗原。配合TCR基因测序,能找出肿瘤突变与免疫系统之间的重要关系,更有助于制定个性化的癌症免疫治疗方案。

02
基于TCR的新抗原预测及验证服务

艾沐蒽新抗原预测,先通过肿瘤组织与血液对照(或癌旁组织)WES测序找到突变基因,结合肿瘤RNA-Seq构建候选新抗原库,再经HLA分型检测、TCR测序,通过艾沐蒽独有算法筛选出基于TCR的最优新抗原与对应TCR;后续新抗原验证,组织充足时可选择抗原质谱检测,不足则用转基因细胞表面呈递验证 。

03
新抗原预测应用
  • 通过预测肿瘤中的特异性新抗原,可以设计个性化的疫苗,激发患者体内免疫系统对肿瘤细胞的特异性免疫反应。艾沐蒽也可以提供疫苗肽序列设计服务,量身设计高效疫苗肽序列。

  • 新抗原还可以用于过继性T细胞治疗(如CAR-T、TCR-T细胞疗法等),通过识别和筛选能够识别新抗原的TCR,可以设计出针对特定新抗原的T细胞,增强对肿瘤的杀伤能力。


艾沐蒽作为精准医疗的先行者,将继续致力于推动个性化免疫疗法的发展,为患者提供更多希望和选择。我们期待与更多的科研机构、企业合作,共同探索精准免疫治疗的无限可能!


关于艾沐蒽


杭州艾沐蒽生物科技有限公司成立于2016年,是国际前沿的专注于免疫驱动医学技术的国家高新技术企业和专精特新企业。创始人团队来自美国芝加哥大学,在2010年开始使用免疫组基因高通量测序技术开展各种疾病相关研究,于2016年通过自主研发,全国首家推出NGS-MRD血液肿瘤微小残留病(MRD)检测Seq-MRD®,并授权泛生子使用。同时,公司拥有Immun-Traq®肿瘤治疗伴随诊断、Immun-Cheq® 免疫力测评以及ImmuHub®免疫组测序科研服务产品,并布局有基于AI机器学习算法的T-classifier®肿瘤早筛、单细胞测序、TCR-T和抗体发现等平台管线。目前为止发表了数十篇论文,其中包括:The New England Journal of Medicine(IF:158.5), Nature(IF:65), Signal Transduction and Targeted Therapy(IF:40), Cellular and Molecular Immunology(IF:24), Nature Communications (IF:17)等多篇高分杂志。公司构建几十项发明专利和软件著作权为核心的自主知识产权体系,为医院临床、生命科学研究、新药开发等提供解决方案和产品。艾沐蒽专注于通过解码适应性免疫系统来改变疾病的诊断和治疗,并致力于推进免疫驱动医学领域发展。


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