V-J基因片段组合表达的3D森林图
对各样本中鉴定到的V和J基因片段组合进行频率计算,并绘制3D森林图。3D森林图直观地体现T细胞受体(TCR)/B细胞受体(BCR)的克隆性和多样性。每根竖条代表了每种V基因片段和J基因片段重组频率,竖条越多,表示T细胞/B细胞的V-J组合种类越多,竖条越长,表示这种组合的频率越高。
用
如图2所示,在艾沐蒽 Immun-Cheq®| T细胞免疫测评中,3D森林图被直观地用来显示受检者T细胞受体(TCR)的多样性。V-J组合种类越多,表示T细胞多样性越高,越有能力抵御疾病。V-J组合频率越高,表示与T细胞的克隆性增殖相关。在这个图中可以明显看到疾病患者和健康人的区别,疾病患者出现明显的克隆性增殖。
X轴:V基因;Y轴:J基因;Z轴:T细胞克隆频率
图2
V/J基因片段表达频率的2D图
图3
TCR被用于宫颈癌患者免疫检测和预后评估。该项研究选取了25位宫颈癌(CC)患者,30位宫颈上皮内瘤变(CIN)患者和20位健康女性,获得外周血样品的TCR库。在65种V基因的使用中,有8种在三组之间存在显著差异,对这8种基因进行分析,如图6所示,除了V5.8和V20.1外,健康女性中其余六个V基因的使用频率显著高于CC和CIN患者,且CC和CIN患者之间无显著差异。
图4
参考文献:
参考文献:
杭州艾沐蒽生物科技有限公司由美国芝加哥大学科研团队回国创办,是一家专注于通过解码适应性免疫系统来改变疾病的诊断和治疗,并致力于推进免疫驱动医学领域发展的国家高新技术企业。艾沐蒽站在适应性免疫系统研究的前沿,自主研发的免疫医学平台可揭示和翻译适应性免疫系统的遗传密码,并能应用于癌症、自身免疫性疾病、传染性疾病等免疫介导性疾病的诊断、监测和治疗中。