奥密克戎疫苗席卷全球,T细胞该它“上场”了!

导读

近日,多地报告发现奥密克戎变异株感染病例,引发广泛关注。  全球新冠病毒数据库GISAID显示,截至1月17日,118个国家提交了奥密克戎病毒基因组序列374314条,奥密克戎变异株已成为全球优势流行株。2021年11月27日,奥密克戎输入中国香港;2021年12月9日,该变异株首次输入中国内地。自2022年1月8日之后,奥密克戎正式在天津、河南、深圳等地发生聚集性感染、跨省传播。

多国流行病学数据提示,奥密克戎变异株传播能力较其他变异株有所增强。世界卫生组织于2021年12月23日关于奥密克戎的简报显示,其家庭续发率为15.8%,高于德尔塔的10.3%。奥密克戎变异株具有传播速度快、病毒载量高、传播能力强等特点。因此,针对疫情,我们必须与病毒赛跑,快速反应!

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疫苗的原理


自2020年新冠病毒突如其来到现在,科学界在不到一年7的时间里为世界带来了各种新的疫苗。这项英勇的工作挽救了数百万人的生命。

疫苗的作用原理就是利用人体的第三道防线(免疫系统),在人健康的状态下,将带有某种抗原的疫苗通过注射或者吞食的方式注入人体,人体在识别到这些抗原后,免疫系统在抗原的刺激下,发生抗原反应,进而产生抗体,这是一种特异性免疫。

现在新冠研发使用的疫苗主要是灭活或减毒后的微生物,人体免疫细胞受到刺激,会分泌一种物质叫抗体(antibody),从而达到免疫(immune)的效果。

但令我们惊讶的是,病毒开始变异得更快。很显然,现如今的疫苗跟不上新冠病毒的变异速度。目前的疫苗根本无法有效预防Omicron的感染。

所以是时候将T细胞纳入对抗Covid-19的研究了。

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 抗体打了折扣,疫苗如何评估? 

奥密克戎在新冠病毒关键蛋白上的大量突变令外界担忧,科学家们最先评估的是中和抗体和疫苗的有效性是否打折扣。

Adaptive Biotechnologies公司和斯坦福大学医学院团队的研究人员2021年12月也在medRxiv上发表了一项研究。他们结合以往实验中确定的新冠疫苗的表位定位,以及从数千名接种疫苗或自然感染的个体中确定的T细胞受体(TCR)库测序,评估奥密克戎变异体的细胞免疫应答的影响。

研究发现,尽管20%的CD4+ T细胞表位可能受到影响,但据估计,CD4+ T细胞介导的免疫损失略高于30%,因为一些受影响的表位相对更具免疫原性。对于CD8+ T细胞,他们估计损失约20%。再加上抗体的中和性预期大幅下降,新冠疫苗提供的整体保护可能受到不利影响。

但他们同时指出,从先前的变异分析来看,疫苗对抗症状性感染的有效性在很大程度上得到了维持,并且与T细胞反应有很强的相关性,但与中和性抗体反应并没有那么强的相关性。“我们预计,SARS-CoV-2疫苗诱导的剩余的70%-80%的靶T细胞仍可降低奥密克戎感染的发病率和死亡率。”研究团队在论文中写道,“新冠病毒似乎违反了疫苗效力主要由抗体中和决定的原则”。

研究团队还指出,通过体液免疫和细胞免疫反应评估预测的新冠疫苗保护效果的差异,突显了T细胞测试作为疫苗诱导免疫保护的可靠措施的重要性,特别是存在可以逃逸免疫监测的新变异体的情况下。他们强调,随着新冠病毒的持续突变,还需要更多的研究来评估T细胞反应的进化预测价值。


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 奥密克戎是否能逃脱T细胞的反应? 

香港科技大学、墨尔本大学等团队的研究人员于1月2日在《病毒学》(Viruses)杂志发表了一项研究,为了确定奥密克戎是否能逃脱T细胞的反应,研究人员分析了1500个SARS-CoV-2表位。他们将在奥密克戎中发现的相关肽序列进行了一系列计算机算法处理,这些算法能够很好地预测某些肽是否能与特定的MHC分子结合。他们发现,只有一些肽可能已经失去了与未突变时相同的MHC分子结合的能力。 

5种新冠关切变异株中S-特异性SARS-CoV-2 T细胞表位有突变和无突变的百分比。香港科技大学、墨尔本大学等团队《病毒学》论文

英国布莱顿和苏塞克斯医学院免疫学主席Florian Kern教授在接受媒体采访时表示,“这让我们相信,对T细胞反应至关重要的绝大多数多肽没有受到奥密克戎中发现的突变的影响,它们仍然会与MHC分子结合。”
香港科技大学电子与计算机工程系的Ahmed Abdul Quadeer博士是这项研究的作者之一,他认为新冠变异体躲避T细胞反应可能相对困难。“这是因为,中和抗体主要识别新冠病毒的刺突蛋白,而T细胞可以识别病毒的多个蛋白质片段。”

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总结和讨论

虽然奥密克戎变异株正在全球范围内迅速传播,但预计SARS-CoV-2的变异将会持续,且奥密克戎不太可能成为最后的“关切变异株”。因此随着新冠病毒的持续突变,还需要更多的研究来评估T细胞反应的进化预测价值,以及提高我们的自身免疫力才是有效控制疫情的关键利器!

注:面对奥密克戎变异株,还需做好防护在日常生活工作中的注意事项

(1)戴口罩仍然是阻断病毒传播的有效方式,对于奥密克戎变异株同样适用。即使在完成全程疫苗接种和接种加强针的情况下,也同样需要在室内公共场所、公共交通工具等场所佩戴口罩。此外,还要勤洗手和做好室内通风。


(2)做好个人健康监测。在有疑似新冠肺炎症状,例如发热、咳嗽、呼吸短促等症状出现时,及时监测体温,主动就诊。


(3)减少非必要出行。尽量不前往高风险国家或地区,如必要前往,要加强旅行途中的个人防护,降低感染奥密克戎变异株的风险。密切关注国内本土聚集性疫情,非必要不前往有疫情的县(市、区、旗),有疫情的地方居民非必要不离开居住地。



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