基于 ct-DNA 的淋巴瘤 MRD 检测:两大技术路线深度解析


淋巴瘤是起源于淋巴造血系统的恶性肿瘤,其病程长、复发风险高,微小残留病(MRD)是判断疗效、预警复发、指导后续治疗的核心指标。随着液体活检技术发展,基于循环肿瘤 DNA(ctDNA)的 MRD 检测凭借无创、灵敏、可动态监测等优势,逐步成为淋巴瘤诊疗的重要手段。

目前主流的淋巴瘤 ctDNA-MRD 检测分为两大技术方向:基于 IG(免疫球蛋白)/ TCR(T细胞受体) 免疫受体重排基于体细胞基因突变。我们结合前沿临床应用,为大家拆解两类技术的原理、特点、优劣及适用场景。


PART 01
什么是 ctDNA ?


ctDNA 全称循环肿瘤 DNA,是肿瘤细胞凋亡、坏死后释放到外周血中的游离 DNA 片段。

正常人体血液中也存在游离 DNA,而 ctDNA 带有肿瘤特有的基因异常,相当于漂浮在血液里的肿瘤 “分子痕迹”。

相较于传统骨髓穿刺、影像学检查,抽取外周血检测 ctDNA 属于无创操作,可规避病灶分布局限、穿刺痛苦等问题,还能更早发现影像学无法识别的微小病灶,实现全身肿瘤负荷的动态监测,也是当下淋巴瘤 MRD 检测的核心载体。


PART 02
基于 ctDNA 的淋巴瘤两大技术路线

淋巴瘤主要起源于 B 细胞、T 细胞,细胞发育过程中会发生特征性基因改变,也由此分化出两条截然不同的 MRD 检测路径,分别是基于 IG/TCR 免疫受体重排检测技术和基于体细胞基因突变检测技术。


路线一:基于 IG/TCR 免疫受体重排的MRD检测

检测原理

B细胞和T细胞表面的受体——IG/TCR会发生独特的 V (D) J 基因重排,形成的独一无二的克隆基因序列如同每个T/B细胞的“基因身份证”。

当T/B细胞发生癌变时,IG/TCR也会大量复制增殖。在初诊时通过高通量测序(NGS)找到出现频率很高的癌细胞克隆基因序列,然后在治疗后对此基因序列进行追踪,评估其残留水平。


核心优势

  • 特异性高。正常淋巴细胞的重排序列多样性高,肿瘤克隆序列辨识度极高,背景干扰少,结果稳定。

  • 灵敏度高。当有足够的DNA输入量时,该技术可在一百万个健康细胞中检测出1个肿瘤细胞,即灵敏度可达10^-6。

  • 标准化程度高。该技术主要适用于淋系血液肿瘤,尤其是在急性淋巴细胞白血病(ALL)、多发性骨髓瘤(MM)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)MRD检测中的应用成熟,已获FDA批准,行业标准相对完善。

现存局限

该技术在淋巴瘤中的应用可及性不如 B/T 系白血病和 MM 。在 ALL、CLL、MM 中,常规是采集骨髓/外周血,提取 gDNA 进行检测;但在淋巴瘤中,某些亚型或分期的淋巴瘤癌细胞未累及骨髓和外周血。因此淋巴瘤的初诊克隆性检测建议使用肿瘤组织样本提取 gDNA 进行检测,找到癌细胞克隆,MRD 追踪检测需要提取外周血 ctDNA 进行残留检测。基于 ctDNA 的检测效能会受外周血肿瘤细胞释放 DNA 水平的影响。

再者,该技术依赖 V(D)J 基因重排的稳定性,淋巴瘤普遍存在体细胞高频突变(SHM),如果肿瘤在演化过程中发生了更进一步的 SHM ,导致引物结合位点改变,则会引发假阴性。

另外,该技术仅能定量肿瘤克隆负荷,无法检测基因突变、拷贝数变异等信息,不能为分子分型、靶向用药、耐药分析提供参考。

路线二:基于体细胞基因突变的 MRD 检测

技术原理

肿瘤在发生发展中会产生特有的体细胞突变(点突变、插入缺失等),这条技术路线以 ctDNA 为检测样本,通过杂交捕获 NGS 技术富集肿瘤突变位点,以此评估微小残留。该路线代表技术为 CAPP-seq,以及其升级版本 PhasED-seq。

  • CAPP-seq:经典杂交捕获 ctDNA 测序技术,panel可一次性检测多个已知驱动突变,不仅能做 MRD 定量,还能同步解析肿瘤突变图谱、基因分型、耐药机制,一站式获取多维度临床信息。该技术通过分子条形码的应用可以区分真实的低频突变和 PCR /测序过程中产生的随机错误,使得其能够在极低的突变丰度下保持高特异性。

  • PhasED-seq:在 CAPP-seq 基础上迭代升级,利用连锁突变算法大幅降低测序背景噪音,灵敏度实现跨越式提升,对于治疗后达到深度缓解、肿瘤负荷极低的患者,检出能力更强。

核心优势

  • 不受 IG/TCR 重排与 SHM 干扰。适配弥漫大 B 细胞淋巴瘤等高发体细胞突变的亚型,适用癌种覆盖面更广,对于非 T/B 细胞基因突变驱动的肿瘤也适用。

  • 信息维度丰富。一次检测兼顾 MRD 评估、突变分析、用药指导,临床价值多元。

  • 灵敏度高。基于 PhasED-seq 的超灵敏检测(LOD

现存局限

一方面,健康人群中存在克隆性造血(CHIP),其基因突变会造成假阳性,影响结果判读;另一方面,部分淋巴瘤亚型驱动突变不明、ctDNA 释放量偏低,容易出现漏检。

同时 PhasED-seq 流程复杂、成本偏高,临床普及度有限。 CAPP-seq 和 PhasED-seq 两类技术大多以实验室自建项目(LDT)形式开展,不同平台结果统一性不足。

总结

ctDNA 技术的普及,让淋巴瘤 MRD 检测迈入无创、精准、动态的新时代。基于 IG/TCR 重排、基于基因突变两大技术路线,分别从 “克隆身份” 和 “肿瘤突变” 两个维度实现残留病灶监测,两条技术路线各有所长,没有绝对的优劣,适配不同临床场景与需求。

  • 若侧重标准化监测、追求高特异性,且适配突变负荷低的淋巴瘤亚型,可选择 IG/TCR 重排路线;

  • 若需要一站式获取突变、用药、MRD 多重信息,基于基因突变的 ctDNA 测序路线更具优势。

PART 03
艾沐蒽双技术布局:SeqMRD® 与 Seq-LMP 淋巴瘤 MRD 检测方案

为全面满足不同临床场景的检测需求,艾沐蒽完成双技术路线布局,自主研发推出两款针对性产品:依托 IG/TCR 克隆重排技术的 Seq-MRD®,以及基于基因突变检测的 Seq-LMP



Seq-MRD®


艾沐蒽 Seq-MRD® 即是基于 IG/TCR 重排检测淋系血液肿瘤( ALL、MM、CLL、B/T 系淋巴瘤) MRD 水平的代表性技术产品,能够帮助临床医生预测长期疗效、评估治疗效果、监测缓解状态以及预测早期复发。


检测类型

检测类型分为初诊的基线检测和治疗后的追踪检测。

(1)癌细胞克隆性检测

通过患者初诊或癌细胞高负荷时的样本,鉴定出显著性克隆(即癌细胞克隆序列)。

(2)MRD 追踪检测

利用筛查出的癌细胞克隆序列,在治疗期间或治疗后评估 MRD 水平,监测癌细胞含量,同时检测识别新出现的癌细胞序列。

需要注意的是,必须先对初诊样本或者肿瘤高负荷样本进行克隆性检测,找到可用于追踪的癌细胞克隆序列之后,才能在治疗后进行 MRD 追踪检测。如果基线检测没有找到可追踪的显著性克隆,即为多克隆型,则不适合此技术方法进行 MRD 追踪。


样本要求

淋巴瘤的初诊克隆性检测建议使用肿瘤组织样本提取 gDNA 进行检测,MRD 追踪检测(治疗后)需要提取外周血 ctDNA 进行残留检测。

若无法提供初诊的肿瘤组织样本,只能提供骨髓/外周血样本的话,需要临床医生确认骨髓/外周血中是有癌细胞累及的。

Seq-MRD® 淋巴瘤送样要求如下:



Seq-LMP


艾沐蒽自主研发的 Seq-LMP 检测体系,运用靶向捕获联合二代测序技术,仅需一次抽血即可分析 DLBCL 患者血液中释放的肿瘤来源 DNA ,涵盖两百多种 B 细胞淋巴瘤关键基因的编码区,能够精准识别点突变、短片段缺失插入及染色体重排等变异类型。该方案支持从初诊协助、治疗应答判断、分子残留病灶追踪到疾病进展提前预警的全周期无创管理。相关检测策略已被2025版 NCCN 指南推荐,为淋巴瘤的个体化诊疗提供了坚实的技术支撑。



关于艾沐蒽


杭州艾沐蒽生物科技有限公司成立于2016年,是国际前沿的专注于免疫驱动医学技术的国家高新技术企业和专精特新企业。创始人团队来自美国芝加哥大学,在2010年开始使用免疫组基因高通量测序技术开展各种疾病相关研究,于2016年通过自主研发,全国首家推出NGS-MRD血液肿瘤微小残留病(MRD)检测Seq-MRD®,并授权泛生子使用。同时,公司拥有Immun-Traq®肿瘤治疗伴随诊断、Immun-Cheq® 免疫力测评以及ImmuHub®免疫组测序科研服务产品,并布局有基于AI机器学习算法的T-classifier®肿瘤早筛、单细胞测序、新抗原、TCR和抗体发现等平台管线。目前为止发表了50余篇论文,其中包括:The New England Journal of Medicine(IF:158.5), The Lancet(IF:98.4), Nature(IF:65), Signal Transduction and Targeted Therapy(IF:40), Cellular and Molecular Immunology(IF:24), Nature Communications (IF:17)等多篇高分杂志。公司构建几十项发明专利和软件著作权为核心的自主知识产权体系,为医院临床、生命科学研究、新药开发等提供解决方案和产品。艾沐蒽专注于通过解码适应性免疫系统来改变疾病的诊断和治疗,并致力于推进免疫驱动医学领域发展。

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