



图1

图2
然后通过scRNA-seq结合scV (D)J-seq对13例患者的外周血样本进行了检测。scRNA-seq得到了7个主要的细胞分类谱系,在7种细胞类型中确定了32种不同的转录状态(图3a)。在这32种细胞状态中,作者发现CD4 T细胞状态5缺乏CCR7和SELL(CD62L)的表达,与CD4 TEM细胞一致,与严重的irAE发育最为密切相关(图3b)。这种状态也与CyTOF测量的CD4 TEM水平最为相关(图3b)。进一步分析发现,CD4 T细胞状态3也显示了与CD4 TEM一致的表达谱(图3c)。当状态3与状态5结合时,所得到的聚类(CD4T 5 + 3)与严重的irAE发育和CyTOF所列举的CD4 TEM水平更显著相关(图3b)。 在经历严重irAEs的患者中,被激活的CD4T 5 + 3细胞的单细胞TCR克隆型多样性(香农熵)升高(受试者工作特征曲线下面积AUC= 0.90,P = 0.05;图3e)。这表明,在总的PBMCs中,激活的CD4 TEM细胞的TCR丰富度是注定要发生严重irAE的患者的治疗前TCR多样性总体增加的基础。 当结合所有可评估的T细胞时,治疗前样本中的TCR高多样性与严重irAE发育之间显著相关(AUC = 0.80;图3e)。这种关联主要归因于具有效应记忆谱的CD4 T细胞(低CCR7和SELL)(图3f)。 总的来说,这些发现表明,基线时bulk外周血中CD4 TEM细胞更多样化的TCR库,与严重ICI毒性的发展相关。图3

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杭州艾沐蒽生物科技有限公司成立于2016年,是国际前沿的专注于免疫驱动医学技术的国家高新技术企业。创始人团队来自美国芝加哥大学,在2010年开始使用免疫组基因高通量测序技术开展各种疾病相关研究,于2016年通过自主研发,全国首家推出NGS-MRD血液肿瘤微小残留病(MRD)检测Seq-MRD®,并授权泛生子(纳斯达克代码:GTH)使用。同时,公司拥有Immun-Traq®肿瘤治疗伴随诊断、Immun-Cheq® |T细胞免疫测评以及ImmuHub®免疫组测序科研服务产品,并布局有基于AI机器学习算法的T-classifier®肿瘤早筛、单细胞测序、TCR-T和抗体发现等平台管线。公司构建几十项发明专利和软件著作权为核心的自主知识产权体系,为医院临床、生命科学研究、新药开发等提供解决方案和产品。艾沐蒽专注于通过解码适应性免疫系统来改变疾病的诊断和治疗,并致力于推进免疫驱动医学领域发展。