图1
图2
然后通过scRNA-seq结合scV (D)J-seq对13例患者的外周血样本进行了检测。scRNA-seq得到了7个主要的细胞分类谱系，在7种细胞类型中确定了32种不同的转录状态（图3a）。在这32种细胞状态中，作者发现CD4 T细胞状态5缺乏CCR7和SELL（CD62L）的表达，与CD4 TEM细胞一致，与严重的irAE发育最为密切相关（图3b）。这种状态也与CyTOF测量的CD4 TEM水平最为相关（图3b）。进一步分析发现，CD4 T细胞状态3也显示了与CD4 TEM一致的表达谱（图3c）。当状态3与状态5结合时，所得到的聚类（CD4T 5 + 3）与严重的irAE发育和CyTOF所列举的CD4 TEM水平更显著相关（图3b）。 在经历严重irAEs的患者中，被激活的CD4T 5 + 3细胞的单细胞TCR克隆型多样性（香农熵）升高（受试者工作特征曲线下面积AUC= 0.90，P = 0.05；图3e）。这表明，在总的PBMCs中，激活的CD4 TEM细胞的TCR丰富度是注定要发生严重irAE的患者的治疗前TCR多样性总体增加的基础。 当结合所有可评估的T细胞时，治疗前样本中的TCR高多样性与严重irAE发育之间显著相关（AUC = 0.80；图3e）。这种关联主要归因于具有效应记忆谱的CD4 T细胞（低CCR7和SELL）（图3f）。 总的来说，这些发现表明，基线时bulk外周血中CD4 TEM细胞更多样化的TCR库，与严重ICI毒性的发展相关。
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杭州艾沐蒽生物科技有限公司成立于2016年，是国际前沿的专注于免疫驱动医学技术的国家高新技术企业。创始人团队来自美国芝加哥大学，在2010年开始使用免疫组基因高通量测序技术开展各种疾病相关研究，于2016年通过自主研发，全国首家推出NGS-MRD血液肿瘤微小残留病（MRD）检测Seq-MRD®，并授权泛生子（纳斯达克代码：GTH）使用。同时，公司拥有Immun-Traq®肿瘤治疗伴随诊断、Immun-Cheq® |T细胞免疫测评以及ImmuHub®免疫组测序科研服务产品，并布局有基于AI机器学习算法的T-classifier®肿瘤早筛、单细胞测序、TCR-T和抗体发现等平台管线。公司构建几十项发明专利和软件著作权为核心的自主知识产权体系，为医院临床、生命科学研究、新药开发等提供解决方案和产品。艾沐蒽专注于通过解码适应性免疫系统来改变疾病的诊断和治疗，并致力于推进免疫驱动医学领域发展。
